Badanie WES (Whole Exome Sequencing) w diagnostyce prenatalnej to jedno z najbardziej zaawansowanych badań genetycznych, jakie możemy dziś wykonać u płodu. Analizuje ono cały egzom, czyli wszystkie części genów kodujące białka — a właśnie tam znajduje się większość znanych mutacji powodujących choroby.

Co dokładnie bada WES?

WES sprawdza sekwencję ok. 20 000 genów, koncentrując się na ich częściach kodujących (eksony).

To pozwala wykryć:

  •  choroby jednogenowe
  •  rzadkie zespoły genetyczne
  • mutacje, których nie widać w klasycznym kariotypie ani mikromacierzy (aCGH)

Kiedy WES ma sens w diagnostyce prenatalnej?

Najczęstsze wskazania:

1. Nieprawidłowości w USG płodu

Zwłaszcza gdy są:

mnogie wady wrodzone

wady ośrodkowego układu nerwowego

wady serca

skrócenie lub deformacje kości

uogólniony obrzęk płodu

ciężkie, „nietypowe” obrazy, które nie pasują do znanych trisomii

 Jeśli kariotyp i mikromacierz są prawidłowe, a obraz USG jest niepokojący — WES jest kolejnym krokiem.

2. Podejrzenie choroby monogenowej

Gdy obraz sugeruje konkretną grupę chorób, np.:

dysplazje kostne

zespoły metaboliczne

choroby nerwowo-mięśniowe

niektóre zespoły genetyczne bez charakterystycznego kariotypu

3. Obciążony wywiad rodzinny

Np.:

wcześniejsze dziecko z niewyjaśnioną chorobą genetyczną

powtarzające się zgony noworodków

znana mutacja w rodzinie, ale obraz kliniczny jest szeroki

 

Z jakiego materiału robi się WES prenatalny?

Najczęściej z:

płynu owodniowego (amniopunkcja)

kosmówki (biopsja trofoblastu)

 

Standardem jest dziś WES trio, czyli badanie:

płodu

matki

ojca

To ogromnie ułatwia interpretację (wiemy, czy mutacja jest nowa – de novo, czy odziedziczona).

 

Co WES może wykryć?

WES dobrze wykrywa:

  • mutacje punktowe
  • małe insercje/delecje
  • wiele znanych mutacji powodujących ciężkie choroby genetyczne

Ale nie jest idealne do wykrywania:

  •  dużych aberracji chromosomowych (od tego jest kariotyp / aCGH)
  •  niektórych zmian strukturalnych
  •  wszystkich mutacji w regionach niekodujących

Czyli: to badanie uzupełniające, a nie zastępujące klasycznej diagnostyki cytogenetycznej.

Czas oczekiwania na wynik

Zwykle:

2–4 tygodnie, w trybie pilnym czasem szybciej (tzw. rapid WES).

W diagnostyce prenatalnej czas jest kluczowy, więc ważna jest współpraca z laboratorium mającym doświadczenie w analizie prenatalnej. 

 

O czym trzeba koniecznie pamiętać?

1. Nie każdy wynik jest jednoznaczny

Często pojawiają się warianty VUS (variant of uncertain significance) — zmiany, których znaczenia jeszcze nie znamy.

2. Możliwe wyniki „przypadkowe”

Można wykryć mutacje niezwiązane z wadą płodu, np. predyspozycje do chorób u rodziców.

3. Konieczna konsultacja genetyczna

 

 

Badanie Co wykrywa najlepiej
Kariotyp duże aberracje chromosomowe (trisomie, translokacje)
Mikromacierz (aCGH) mikrodelecje i mikroduplikacje
WES choroby jednogenowe i rzadkie zespoły genetyczne